Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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GBX1Q14549 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GBX1Q14549 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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GBX1Q14549 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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GBX1Q14549 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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GBX1Q14549 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
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GBX1Q14549 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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GBX1Q14549 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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GBX1Q14549 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
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GBX1Q14549 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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GBX1Q14549 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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GBX1Q14549 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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GBX1Q14549 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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GBX1Q14549 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GBX1Q14549 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
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