Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLF9Q13886 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLF9Q13886 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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