Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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