Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GRIK3Q13003 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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