Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPTFQ12830 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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