Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RASGEF1BQ0VAM2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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