Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CD47Q08722 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD47Q08722 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD47Q08722 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD47Q08722 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD47Q08722 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD47Q08722 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD47Q08722 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD47Q08722 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD47Q08722 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD47Q08722 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD47Q08722 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD47Q08722 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD47Q08722 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CD47Q08722 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD47Q08722 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CD47Q08722 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD47Q08722 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CD47Q08722 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD47Q08722 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD47Q08722 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD47Q08722 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD47Q08722 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD47Q08722 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CD47Q08722 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD47Q08722 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CD47Q08722 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD47Q08722 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD47Q08722 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CD47Q08722 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD47Q08722 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD47Q08722 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD47Q08722 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD47Q08722 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD47Q08722 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD47Q08722 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD47Q08722 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD47Q08722 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD47Q08722 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD47Q08722 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD47Q08722 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD47Q08722 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD47Q08722 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD47Q08722 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD47Q08722 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD47Q08722 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD47Q08722 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD47Q08722 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD47Q08722 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD47Q08722 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD47Q08722 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD47Q08722 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD47Q08722 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD47Q08722 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD47Q08722 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD47Q08722 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD47Q08722 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms