Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms