Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE4CQ08493 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms