Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms