Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL16A1Q07092 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COL16A1Q07092 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms