Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FMODQ06828 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FMODQ06828 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FMODQ06828 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FMODQ06828 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
FMODQ06828 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FMODQ06828 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FMODQ06828 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FMODQ06828 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FMODQ06828 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FMODQ06828 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FMODQ06828 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms