Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC18A2Q05940 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms