Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
ERCC6Q03468 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC31■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC31■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ERCC6Q03468 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms