Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MYBPC1Q00872 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MYBPC1Q00872 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms