Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTBP60709 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACTBP60709 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACTBP60709 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTBP60709 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACTBP60709 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms