Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC01547P58512 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
LINC01547P58512 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms