Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC5A3P53794 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC5A3P53794 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC5A3P53794 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC5A3P53794 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC5A3P53794 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC5A3P53794 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms