Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TTPAP49638 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTPAP49638 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTPAP49638 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTPAP49638 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTPAP49638 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTPAP49638 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTPAP49638 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TTPAP49638 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTPAP49638 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TTPAP49638 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTPAP49638 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTPAP49638 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TTPAP49638 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTPAP49638 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TTPAP49638 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTPAP49638 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TTPAP49638 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTPAP49638 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTPAP49638 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTPAP49638 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTPAP49638 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTPAP49638 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTPAP49638 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTPAP49638 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TTPAP49638 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TTPAP49638 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TTPAP49638 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTPAP49638 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTPAP49638 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTPAP49638 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTPAP49638 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TTPAP49638 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTPAP49638 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTPAP49638 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TTPAP49638 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTPAP49638 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTPAP49638 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTPAP49638 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTPAP49638 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTPAP49638 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTPAP49638 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTPAP49638 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TTPAP49638 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTPAP49638 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTPAP49638 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTPAP49638 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTPAP49638 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTPAP49638 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTPAP49638 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTPAP49638 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTPAP49638 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTPAP49638 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTPAP49638 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTPAP49638 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTPAP49638 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTPAP49638 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms