Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POU3F4P49335 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms