Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PXNP49023 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PXNP49023 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PXNP49023 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PXNP49023 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PXNP49023 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PXNP49023 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PXNP49023 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PXNP49023 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PXNP49023 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PXNP49023 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PXNP49023 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PXNP49023 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PXNP49023 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PXNP49023 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PXNP49023 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PXNP49023 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PXNP49023 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PXNP49023 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PXNP49023 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PXNP49023 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PXNP49023 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PXNP49023 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PXNP49023 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PXNP49023 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PXNP49023 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PXNP49023 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PXNP49023 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PXNP49023 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PXNP49023 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PXNP49023 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PXNP49023 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PXNP49023 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PXNP49023 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PXNP49023 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PXNP49023 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PXNP49023 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PXNP49023 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PXNP49023 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PXNP49023 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PXNP49023 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PXNP49023 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PXNP49023 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PXNP49023 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PXNP49023 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PXNP49023 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PXNP49023 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PXNP49023 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PXNP49023 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PXNP49023 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PXNP49023 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PXNP49023 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PXNP49023 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PXNP49023 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PXNP49023 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PXNP49023 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PXNP49023 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PXNP49023 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PXNP49023 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PXNP49023 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PXNP49023 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PXNP49023 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PXNP49023 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PXNP49023 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PXNP49023 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PXNP49023 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms