Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ETV4P43268 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV4P43268 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV4P43268 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV4P43268 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV4P43268 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV4P43268 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV4P43268 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV4P43268 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV4P43268 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV4P43268 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV4P43268 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV4P43268 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ETV4P43268 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ETV4P43268 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ETV4P43268 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ETV4P43268 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ETV4P43268 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ETV4P43268 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ETV4P43268 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ETV4P43268 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ETV4P43268 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ETV4P43268 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV4P43268 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV4P43268 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV4P43268 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV4P43268 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV4P43268 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV4P43268 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV4P43268 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV4P43268 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV4P43268 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV4P43268 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV4P43268 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV4P43268 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV4P43268 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV4P43268 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV4P43268 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV4P43268 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV4P43268 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ETV4P43268 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms