Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTHFRP42898 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTHFRP42898 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms