Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FLT4P35916 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FLT4P35916 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FLT4P35916 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FLT4P35916 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FLT4P35916 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FLT4P35916 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FLT4P35916 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FLT4P35916 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FLT4P35916 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FLT4P35916 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FLT4P35916 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FLT4P35916 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FLT4P35916 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FLT4P35916 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FLT4P35916 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FLT4P35916 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FLT4P35916 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FLT4P35916 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FLT4P35916 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FLT4P35916 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FLT4P35916 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FLT4P35916 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FLT4P35916 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FLT4P35916 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FLT4P35916 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FLT4P35916 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FLT4P35916 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FLT4P35916 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FLT4P35916 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FLT4P35916 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FLT4P35916 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FLT4P35916 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FLT4P35916 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FLT4P35916 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FLT4P35916 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FLT4P35916 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FLT4P35916 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FLT4P35916 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FLT4P35916 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FLT4P35916 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FLT4P35916 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FLT4P35916 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FLT4P35916 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FLT4P35916 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FLT4P35916 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FLT4P35916 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FLT4P35916 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FLT4P35916 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FLT4P35916 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FLT4P35916 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FLT4P35916 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FLT4P35916 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FLT4P35916 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FLT4P35916 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FLT4P35916 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FLT4P35916 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FLT4P35916 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FLT4P35916 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FLT4P35916 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FLT4P35916 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FLT4P35916 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FLT4P35916 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FLT4P35916 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FLT4P35916 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FLT4P35916 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FLT4P35916 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLT4P35916 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLT4P35916 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLT4P35916 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLT4P35916 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLT4P35916 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLT4P35916 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLT4P35916 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLT4P35916 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLT4P35916 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLT4P35916 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLT4P35916 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLT4P35916 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLT4P35916 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLT4P35916 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FLT4P35916 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLT4P35916 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLT4P35916 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FLT4P35916 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLT4P35916 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLT4P35916 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLT4P35916 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLT4P35916 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLT4P35916 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLT4P35916 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLT4P35916 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FLT4P35916 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FLT4P35916 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FLT4P35916 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FLT4P35916 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FLT4P35916 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FLT4P35916 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FLT4P35916 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FLT4P35916 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms