Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPC1P35052 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPC1P35052 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPC1P35052 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms