Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLIP1P30622 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms