Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF2E1P29083 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF2E1P29083 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms