Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PTPRMP28827 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PTPRMP28827 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
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