Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
POLR2AP24928 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms