Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRHP20396 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TRHP20396 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRHP20396 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TRHP20396 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRHP20396 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRHP20396 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRHP20396 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRHP20396 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRHP20396 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRHP20396 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRHP20396 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRHP20396 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRHP20396 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRHP20396 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRHP20396 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TRHP20396 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRHP20396 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRHP20396 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRHP20396 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRHP20396 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRHP20396 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRHP20396 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRHP20396 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRHP20396 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRHP20396 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRHP20396 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRHP20396 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRHP20396 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRHP20396 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRHP20396 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRHP20396 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRHP20396 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRHP20396 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRHP20396 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRHP20396 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRHP20396 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRHP20396 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRHP20396 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRHP20396 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRHP20396 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRHP20396 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRHP20396 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRHP20396 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRHP20396 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRHP20396 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRHP20396 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRHP20396 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRHP20396 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRHP20396 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRHP20396 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRHP20396 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRHP20396 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRHP20396 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRHP20396 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRHP20396 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRHP20396 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRHP20396 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRHP20396 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRHP20396 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRHP20396 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRHP20396 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRHP20396 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRHP20396 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
TRHP20396 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRHP20396 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRHP20396 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRHP20396 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRHP20396 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRHP20396 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRHP20396 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRHP20396 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRHP20396 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TRHP20396 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRHP20396 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRHP20396 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRHP20396 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRHP20396 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TRHP20396 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRHP20396 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRHP20396 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRHP20396 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRHP20396 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRHP20396 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRHP20396 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRHP20396 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRHP20396 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRHP20396 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRHP20396 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRHP20396 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRHP20396 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRHP20396 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRHP20396 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRHP20396 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRHP20396 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRHP20396 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRHP20396 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRHP20396 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRHP20396 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRHP20396 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms