Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI3P10071 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI3P10071 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI3P10071 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI3P10071 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI3P10071 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI3P10071 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI3P10071 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI3P10071 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI3P10071 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI3P10071 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI3P10071 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI3P10071 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI3P10071 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI3P10071 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI3P10071 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI3P10071 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI3P10071 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI3P10071 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI3P10071 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI3P10071 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI3P10071 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI3P10071 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI3P10071 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI3P10071 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI3P10071 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI3P10071 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI3P10071 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI3P10071 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI3P10071 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI3P10071 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI3P10071 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI3P10071 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI3P10071 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI3P10071 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI3P10071 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI3P10071 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI3P10071 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI3P10071 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI3P10071 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI3P10071 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI3P10071 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI3P10071 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI3P10071 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI3P10071 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI3P10071 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI3P10071 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI3P10071 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI3P10071 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI3P10071 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI3P10071 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI3P10071 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI3P10071 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI3P10071 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI3P10071 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI3P10071 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI3P10071 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI3P10071 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI3P10071 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI3P10071 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI3P10071 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI3P10071 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI3P10071 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GLI3P10071 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI3P10071 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI3P10071 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI3P10071 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI3P10071 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI3P10071 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI3P10071 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GLI3P10071 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms