Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEFLP07196 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEFLP07196 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEFLP07196 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NEFLP07196 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEFLP07196 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEFLP07196 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEFLP07196 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEFLP07196 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEFLP07196 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEFLP07196 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEFLP07196 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEFLP07196 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEFLP07196 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEFLP07196 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEFLP07196 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEFLP07196 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEFLP07196 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEFLP07196 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEFLP07196 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEFLP07196 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEFLP07196 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NEFLP07196 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFLP07196 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFLP07196 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFLP07196 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFLP07196 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFLP07196 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFLP07196 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFLP07196 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFLP07196 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFLP07196 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFLP07196 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFLP07196 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFLP07196 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFLP07196 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFLP07196 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFLP07196 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFLP07196 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFLP07196 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFLP07196 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFLP07196 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFLP07196 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFLP07196 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFLP07196 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NEFLP07196 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFLP07196 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFLP07196 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFLP07196 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFLP07196 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFLP07196 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFLP07196 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFLP07196 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFLP07196 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFLP07196 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFLP07196 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFLP07196 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFLP07196 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFLP07196 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFLP07196 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFLP07196 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFLP07196 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFLP07196 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFLP07196 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NEFLP07196 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFLP07196 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFLP07196 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFLP07196 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFLP07196 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFLP07196 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFLP07196 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFLP07196 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFLP07196 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFLP07196 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFLP07196 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFLP07196 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFLP07196 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFLP07196 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFLP07196 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFLP07196 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFLP07196 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFLP07196 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEFLP07196 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEFLP07196 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms