Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB3P05106 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3P05106 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms