Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYBBP04839 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYBBP04839 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYBBP04839 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CYBBP04839 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYBBP04839 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CYBBP04839 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYBBP04839 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CYBBP04839 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYBBP04839 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYBBP04839 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYBBP04839 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYBBP04839 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYBBP04839 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYBBP04839 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYBBP04839 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CYBBP04839 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYBBP04839 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYBBP04839 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYBBP04839 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYBBP04839 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYBBP04839 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYBBP04839 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYBBP04839 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYBBP04839 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYBBP04839 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYBBP04839 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYBBP04839 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYBBP04839 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CYBBP04839 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYBBP04839 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYBBP04839 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYBBP04839 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYBBP04839 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYBBP04839 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYBBP04839 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYBBP04839 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYBBP04839 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CYBBP04839 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYBBP04839 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYBBP04839 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYBBP04839 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYBBP04839 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYBBP04839 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYBBP04839 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYBBP04839 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYBBP04839 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYBBP04839 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYBBP04839 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYBBP04839 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYBBP04839 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CYBBP04839 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CYBBP04839 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYBBP04839 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYBBP04839 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYBBP04839 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYBBP04839 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYBBP04839 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYBBP04839 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYBBP04839 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYBBP04839 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYBBP04839 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYBBP04839 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CYBBP04839 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CYBBP04839 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CYBBP04839 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CYBBP04839 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CYBBP04839 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CYBBP04839 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CYBBP04839 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CYBBP04839 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CYBBP04839 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CYBBP04839 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CYBBP04839 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CYBBP04839 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CYBBP04839 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CYBBP04839 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYBBP04839 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYBBP04839 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYBBP04839 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYBBP04839 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYBBP04839 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYBBP04839 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYBBP04839 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYBBP04839 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYBBP04839 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CYBBP04839 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYBBP04839 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYBBP04839 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYBBP04839 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYBBP04839 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYBBP04839 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYBBP04839 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYBBP04839 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYBBP04839 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYBBP04839 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYBBP04839 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYBBP04839 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CYBBP04839 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CYBBP04839 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms