Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
POP4O95707 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POP4O95707 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POP4O95707 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POP4O95707 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POP4O95707 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POP4O95707 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POP4O95707 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POP4O95707 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POP4O95707 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POP4O95707 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POP4O95707 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POP4O95707 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POP4O95707 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POP4O95707 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
POP4O95707 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POP4O95707 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POP4O95707 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
POP4O95707 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POP4O95707 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
POP4O95707 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POP4O95707 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POP4O95707 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
POP4O95707 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
POP4O95707 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POP4O95707 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
POP4O95707 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POP4O95707 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POP4O95707 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POP4O95707 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POP4O95707 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POP4O95707 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POP4O95707 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
POP4O95707 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POP4O95707 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POP4O95707 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
POP4O95707 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POP4O95707 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POP4O95707 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POP4O95707 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POP4O95707 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POP4O95707 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POP4O95707 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POP4O95707 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POP4O95707 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POP4O95707 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
POP4O95707 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POP4O95707 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POP4O95707 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POP4O95707 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
POP4O95707 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
POP4O95707 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms