Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFL1O94874 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFL1O94874 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFL1O94874 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFL1O94874 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFL1O94874 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UFL1O94874 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFL1O94874 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFL1O94874 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UFL1O94874 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFL1O94874 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFL1O94874 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFL1O94874 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UFL1O94874 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFL1O94874 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UFL1O94874 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFL1O94874 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFL1O94874 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFL1O94874 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFL1O94874 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UFL1O94874 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFL1O94874 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFL1O94874 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFL1O94874 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFL1O94874 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UFL1O94874 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFL1O94874 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFL1O94874 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFL1O94874 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFL1O94874 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFL1O94874 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFL1O94874 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFL1O94874 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFL1O94874 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFL1O94874 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFL1O94874 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFL1O94874 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UFL1O94874 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UFL1O94874 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFL1O94874 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFL1O94874 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFL1O94874 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFL1O94874 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFL1O94874 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFL1O94874 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFL1O94874 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFL1O94874 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFL1O94874 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFL1O94874 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFL1O94874 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFL1O94874 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFL1O94874 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFL1O94874 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFL1O94874 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFL1O94874 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFL1O94874 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFL1O94874 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFL1O94874 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFL1O94874 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFL1O94874 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFL1O94874 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFL1O94874 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFL1O94874 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFL1O94874 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFL1O94874 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFL1O94874 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFL1O94874 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFL1O94874 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFL1O94874 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFL1O94874 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFL1O94874 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFL1O94874 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFL1O94874 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFL1O94874 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UFL1O94874 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UFL1O94874 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UFL1O94874 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UFL1O94874 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UFL1O94874 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UFL1O94874 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UFL1O94874 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UFL1O94874 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UFL1O94874 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UFL1O94874 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UFL1O94874 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UFL1O94874 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UFL1O94874 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UFL1O94874 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UFL1O94874 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UFL1O94874 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UFL1O94874 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UFL1O94874 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UFL1O94874 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UFL1O94874 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UFL1O94874 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UFL1O94874 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UFL1O94874 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UFL1O94874 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UFL1O94874 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UFL1O94874 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms