Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB11FIP3O75154 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB11FIP3O75154 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms