Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CTNSO60931 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CTNSO60931 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTNSO60931 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNSO60931 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNSO60931 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNSO60931 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNSO60931 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNSO60931 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNSO60931 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNSO60931 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNSO60931 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNSO60931 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNSO60931 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTNSO60931 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms