Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD21O60216 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD21O60216 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD21O60216 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD21O60216 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD21O60216 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD21O60216 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD21O60216 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD21O60216 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD21O60216 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD21O60216 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD21O60216 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD21O60216 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD21O60216 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD21O60216 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD21O60216 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD21O60216 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD21O60216 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD21O60216 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD21O60216 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD21O60216 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD21O60216 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD21O60216 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD21O60216 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD21O60216 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD21O60216 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD21O60216 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD21O60216 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD21O60216 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD21O60216 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD21O60216 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD21O60216 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD21O60216 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD21O60216 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD21O60216 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD21O60216 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD21O60216 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD21O60216 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD21O60216 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD21O60216 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD21O60216 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD21O60216 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD21O60216 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD21O60216 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD21O60216 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD21O60216 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD21O60216 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD21O60216 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD21O60216 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD21O60216 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD21O60216 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD21O60216 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD21O60216 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD21O60216 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD21O60216 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD21O60216 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD21O60216 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD21O60216 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD21O60216 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD21O60216 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD21O60216 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAD21O60216 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAD21O60216 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAD21O60216 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RAD21O60216 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAD21O60216 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAD21O60216 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAD21O60216 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD21O60216 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD21O60216 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD21O60216 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD21O60216 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD21O60216 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD21O60216 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD21O60216 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD21O60216 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD21O60216 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD21O60216 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD21O60216 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD21O60216 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD21O60216 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD21O60216 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD21O60216 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD21O60216 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD21O60216 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD21O60216 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD21O60216 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD21O60216 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD21O60216 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAD21O60216 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD21O60216 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD21O60216 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD21O60216 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD21O60216 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD21O60216 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD21O60216 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD21O60216 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD21O60216 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD21O60216 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAD21O60216 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms