Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ2O43526 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ2O43526 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ2O43526 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ2O43526 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ2O43526 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ2O43526 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ2O43526 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ2O43526 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ2O43526 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ2O43526 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ2O43526 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ2O43526 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ2O43526 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ2O43526 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ2O43526 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ2O43526 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ2O43526 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ2O43526 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ2O43526 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ2O43526 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KCNQ2O43526 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNQ2O43526 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms