Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSH5O43196 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSH5O43196 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSH5O43196 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSH5O43196 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSH5O43196 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSH5O43196 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSH5O43196 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MSH5O43196 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSH5O43196 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSH5O43196 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSH5O43196 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MSH5O43196 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSH5O43196 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSH5O43196 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSH5O43196 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MSH5O43196 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSH5O43196 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MSH5O43196 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MSH5O43196 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSH5O43196 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSH5O43196 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSH5O43196 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSH5O43196 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MSH5O43196 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 AC003986.3-201ENST00000417460 692 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 RSF1-IT1-201ENST00000528233 632 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MSH5O43196 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSH5O43196 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSH5O43196 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSH5O43196 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSH5O43196 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSH5O43196 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSH5O43196 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSH5O43196 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSH5O43196 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSH5O43196 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSH5O43196 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSH5O43196 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSH5O43196 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSH5O43196 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSH5O43196 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSH5O43196 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSH5O43196 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSH5O43196 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSH5O43196 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSH5O43196 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSH5O43196 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSH5O43196 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSH5O43196 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSH5O43196 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MSH5O43196 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSH5O43196 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSH5O43196 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSH5O43196 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSH5O43196 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSH5O43196 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSH5O43196 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSH5O43196 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSH5O43196 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSH5O43196 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSH5O43196 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSH5O43196 POLR2K-201ENST00000353107 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSH5O43196 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSH5O43196 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSH5O43196 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MSH5O43196 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MSH5O43196 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MSH5O43196 AC005534.1-201ENST00000455709 742 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSH5O43196 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSH5O43196 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MSH5O43196 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MSH5O43196 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms