Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBDO15205 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBDO15205 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBDO15205 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBDO15205 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBDO15205 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBDO15205 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBDO15205 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UBDO15205 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBDO15205 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBDO15205 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBDO15205 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBDO15205 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBDO15205 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBDO15205 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBDO15205 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBDO15205 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBDO15205 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UBDO15205 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBDO15205 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBDO15205 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UBDO15205 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBDO15205 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBDO15205 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBDO15205 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBDO15205 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBDO15205 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBDO15205 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBDO15205 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBDO15205 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBDO15205 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBDO15205 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBDO15205 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBDO15205 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UBDO15205 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBDO15205 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBDO15205 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBDO15205 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBDO15205 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UBDO15205 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
UBDO15205 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBDO15205 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UBDO15205 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms