Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNAP23O00161 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms