Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHLDA3Q9Y5J5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms