Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2J1Q9Y385 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms