Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPC6Q9Y210 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms