Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
TRAK1Q9UPV9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAK1Q9UPV9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms