Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHF8Q9UPP1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHF8Q9UPP1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms