Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCML1Q9UN30 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms