Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHIC2Q9UKJ5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHIC2Q9UKJ5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms